A 為了達成「成為世界第一的偵探！」願望，小Q挑戰的是傳說中的名偵探──團守彥所主辨的「偵探學園」突破傳統的入學測驗！一起與瞬間記憶者小惠、野性男兒金太、IT小鬼數馬等強大對手，解開各種超難解的謎題！為了能進入最頂尖的偵探養成班「Q CLASS」，五個各懷技能的偵探少年，被逼流落在孤島上，所面對的強大敵人，竟然是世人聞風喪膽的「開膛手傑克」？接續金田一神話的精彩推理鉅著亦由此而展開……
B 以小Q為首第一次踏進偵探學園的五個成員，第一個被團學園長交付的任務，就是解開位於深山的兩個村落所發生難以理解的失蹤事件──「憑空消失」之謎。來到村子的五個成員， 到關於舊日本軍的寶藏傳說，以及圍繞著疫神教這個奇妙宗教的傳言。正當此時，「憑空消失殺人事件」發生了……！
C 收到了半年前自殺身亡的天才小提琴家，寶生美鶴所寄來的恐嚇信？為了解開此迷團，小Ｑ他們前往「幻奏館」。但是卻發生為了爭奪九頭龍匠所做的小提琴「TESTA．DI．DORAGO」從地獄甦醒的「冥界的藝術大師」所彈奏的死忘旋律……「魔鬼的顫音」卻在被暴風雨所徽值纳角f裡響起……
D 破解隱藏在「紫雲龍」與「日記」當中訊息所浮現出天才藝術家．九頭龍匠本身的謎究竟是……？而特別所面對的全新事件，是被水泥磚所封死的完全密室殺人﹗為了保護村子免於被水壩所淹沒，傳說中的守護神「魔矢姬」用“人柱的詛咒之火”將入侵者燃燒殆盡…﹗
E 哂猛耆�密室的心理盲點的手法是…？號稱是團先生心腹(不過人很怪)的骷髏頭博士所提出完美無缺的不在場證明之謎又是…？隱藏在小Q所拍到的“靈異照片”當中，令人意想不到企圖是…？特別班很巧妙的針對接連發生的怪異事件、難解事件加以抽絲剝繭﹗偵探學園的「重新編班的測驗即將到來」
F 這次的對像是外星人跟幽靈?特別班將挑戰這世上所發生不可思議的奇怪現象！一夜之間突然出現的「神秘圓圈」之謎！在試膽大賽當中不知何時加入的幽靈?再加上發生與九頭龍匠所畫的幽靈畫牽扯不清的連續殺人事件！背後隱藏的是宿敵『冥王星』的幹部賽柏拉斯的身影…！
G 小Q無意間到小流不為人知的真正身分。信賴與友情產生激烈的衝突。在蘊含決裂危機之下，特別班挑戰在賽柏拉斯的巧妙計劃下所進行的「雪月花」比喻人之謎！連團先生都親自出面的推理對決，所引導出令人驚訝的三重解決！在讓人眼花撩亂的逆轉故事的最後，超乎想像的真兇手會是…?