「Frontier」船團迎來了出身于鄰近船團「Macross Galaxy」的偶像歌手「雪莉爾 諾姆」的演唱會。

雪莉爾是在銀河網絡流行歌曲排行榜上長期占據榜首的頂尖偶像。而有個女孩子則一直憧憬著那樣的雪莉爾，她的名字叫蘭花 李，是個在中餐店里打工的非常平凡的高中女生，家里的親人只有一個年齡相差很大的哥哥奧茲瑪。

奧茲瑪是領軍方特種部隊SMS中負責率領女武神戰斗機部隊的精銳飛行員。但是怕妹妹擔心的他一直對蘭花隱瞞著自己高危險的戰斗機飛行員的工作。

在蘭花急匆匆的趕往自己期待已久的雪莉爾演唱會的途中，她與飛行員培養學校的高中生「早乙女 阿爾特」邂逅了。

這是一段在高中生活中隨處可見的相遇……

但在那時，「Frontier」突然遭遇了未知的敵人。而對方既不是地球人也不是異星人，是謎一般的宇宙生物。新 統合軍部隊不斷遭受損失，敵人擁有連軍隊的VF部隊也深為忌憚的攻擊能力。但接著市民的居住區也遭到了宇宙生物的入侵，為了解決危機，奧茲瑪率領的SMS的VF-25部隊出動了……

到底這些宇宙生物有多少？它們有什么能力？它們的目的又是什么呢？
然后，人類又會作出怎樣的選擇呢……？！

主要制作人員是以河森正治為首的「Macross」系列制作班底，新加入了在「Macross」系列世界觀下成長起來的年輕實力派制作者。以銀河為舞臺向大家展現出真正的SF和愛情故事。當然可變式戰斗機“女武神“的最新銳機體VF-25也將登場。以最新的CG效果表現出來的洗練流暢的機體動作，特別是宇宙空間的近身絞殺戰，將比前作「Macross Zero」更加值得期待