由於富士台2009年4~6月放送的BOSS備受好評，要求續篇的呼聲高漲。應觀眾們的期待與要求，時隔兩年，BOSS2終於出爐！兩年前，從美國回來的大澤繪里子（天海佑希飾），應老友野立信次郎（竹野內豐飾）之邀，擔任警視廳搜查一科新設部門“特別犯罪對策室”的室長。然而，被野立召喚至對策室的成員都是各有怪癖、極富個性的警察中的“極品”，但是，在BOSS的帶領下，他們卻接連解決了疑難奇案，構築了各自之間的羈絆，成為了一個優秀的破案團隊…… 然而，兩年前，由於插手了警視廳高層貪污案，BOSS解散了“特別犯罪對策室”，決定離開日本前往美國… … 此次續篇始於前回的最後一幕。即將離開日本的繪里子，在機場接到野立的來電……反政府組織“黑月”聲稱下一目標為國家公安委員長黑原健藏（西田敏行飾），而且於當日活動會場行凶的可能性極大。野立召集對策室成員趕往現場，繪里子也從機場折回……與此同時，押送途中的“黑月”頭領高倉隆平（反町隆史飾）逃脫……對策室極力找尋兇犯，然而，黑原委員長最終仍被兇犯槍擊中彈、身負重傷，兇犯逃之夭夭…… 於是，對策室承擔責任，再次解散，繪里子去了美國…… 那之後的兩年，繪里子及對策室的成員各自在警界大展拳腳。為此，晉升為參事官的野立接下了一起重案，欲藉此再次重組對策室……