從大正到昭和的這段時光，20世紀20~30年代的日本動盪不安，貧困與疾病，加上不景氣的經濟和破壞力巨大的關東大地震，讓生活在這座島嶼上的人民惶惶不可終日。而隨著戰爭腳步的臨近，年輕人們的未來愈加變得撲朔迷離，捉摸不定。
自幼便對飛機報以濃厚興趣的堀越二郎??（庵野秀明配音），與他所景仰的意大利飛機設計師卡普羅尼（野村萬齋配音）建立了穿越時空的友情，並從對方那裡汲取勇氣和靈感。他發誓設計並製造出優美的飛機，長大後如願考入東京某大學學習航空工學。在此之後，他遠赴德國留學，憑藉自身掌握的航空技術，二郎成為一名戰鬥機設計師，經典機型七試艦上戰鬥機（九六式艦上戰鬥機）便曾留下他智慧的結晶。可在一次試飛中，他的飛機意外墜毀，頗受打擊的二郎前往位於長野縣北佐久郡的輕井澤療養，誰知竟在那裡結識了一生的最愛。縱有疾風起,人生不言棄她叫菜穗子（瀧本美織配音），在1923年9月1日（日本十年前的關東大地震期間）曾與二郎有過一面之緣。兩人一見鍾情，彼此約定相守終生。然而菜穗子罹患了在當時被視作絕症的肺結核，前方的道路一片黑暗。始終無法放棄製造美麗飛機的夢想，二郎再度投身零式戰鬥機的設計工作中去。另一方面，情知去日無多的菜穗子偷偷溜出療養院，奔向她的愛人二郎。動蕩的年代，有限的生命，青年男女風中殘燭般的飄搖愛情……