本作的主人公是一位名叫津崎青葉的女孩，她明亮開朗，富有朝氣。某天，津崎青葉突然被神秘人士綁架，並被帶到南美洲委內瑞拉一個叫做“天使”的組織裡。在那裡在，津崎青葉被迫成為了叫做“人機”的巨型機器人兵器的駕駛員。而青葉的好朋友黃坂露伊，也作為莫利比特2號操縱者被一起捲進了戰鬥中。三年之後，世界各地都出現了瞬間將整個城市毀滅的可怕事件，實際上，這是一個名為基姆的組織使用“人機”對世界各地進行攻擊所造成的。為此，“天使”展開了對該組織的追擊。另一方面，在日本東京，失去了三年前全部記憶的女孩赤緒為了保衛朋友們，加入了“天使”，同基姆展開了戰鬥……