《夢玉屋奇談》講述11歲的菜穂和父親、2歲的弟弟一起生活，由於母親在生了弟弟後不久就去世了，在家裡是由菜穂照料著年紀小的弟弟。因為弟弟的存在，菜穂不能跟朋友去玩，有時也顯得好煩躁。有一天，一個叫可塔羅的人使用了能使人所期望的世界變為夢，並將其帶入夢中世界的神秘道具夢玉，將菜穂帶入了她弟弟的夢裡。不久，在弟弟夢裡的菜穂終於能和朋友玩了，但她其實不知道，她正被可塔羅玩弄著。之後菜穂在夢中迎來了與父親和已死去的母親共處的時間，而唯獨少了弟弟，她開始迷惑起來。究竟菜穂所期望的是什麼呢？