三年前的一天深夜，某海島小屋發生了一起密室殺人案。被害人在反鎖的屋內被銳物刺穿胸背，所在小屋亦被燒毀。已為警察的草薙俊平（北村一輝飾）回到母校帝都大學，邀請12年不見的老同學湯川學（福山雅治飾）協助破案。湯川學一行來到案發現場附近，一邊享受海灘風光一邊尋找案件線索。隨著殺人案偵破工作的推進，只為還原案件物理原理的湯川學逐步逼近著案件的真相，只是此時的他尚未意識到，人心亦是一門科學。片中亦穿插了一段湯川學與草薙俊平的往事。在海風的吹拂下，草薙俊平向湯川學的學生塩野谷（長澤雅美飾）講述了一起令他與年少湯川學（三浦春馬飾）在大二結緣的案件……...