該作講述了不列顛帝國依靠超級武器——人形的機器人Nightmare Flame吞并了許多國家，其中也包括了日本。男主人公魯路修身為帝國的王子，作為人質正好在日本目睹了這一切，他決定毀滅掉萬惡的根源，自己的祖國。一次意外的事件將魯魯修和朱雀卷入了布里塔尼亞軍對“11”的屠殺中，魯魯修從一位神秘卻有著神奇力量的少女C.C.的身上得到了名為GEASS的力量，可以控制別人精神的絕對力量。魯魯修決心以此為武器來破壞布里塔尼亞帝國的強權統治，為了替母親報仇，并締造一個能讓妹妹娜娜麗幸福生活的世界。殺死第三皇兄克洛維斯，組辦黑色騎士團……他蒙著面，稱自己為“ZERO”。

而他在日本的好友朱雀和他出于同樣的目的，卻走上了相反的方向，加入了不列顛軍隊，并且不贊同ZERO為了建立新世界而殺死很多人的做法……