多路獸：本作中的主角數碼獸，因擁有「Ｘ抗體」一開始受到其它數碼獸的排斥，后因看到同伴接連受到傷害，在逆境中回憶起同伴鼓勵的場景而不斷在悲憤中進化，最后進化成為傳說中的第十三位皇家騎士——阿爾法獸。進化階段：多路獸——多路加獸——多路龍獸——阿爾法獸獅子獸：一開始追殺多路獸，試圖獲得其「Ｘ抗體」，后因身中世界樹的「Ｘ計劃」而死，臨死前覺悟到即使自己獲得了「Ｘ抗體」也無法在新世界生存。迪哥獸：多次受眾人保護而大難不死的幼年期數碼獸，后來得到了鋼鐵加魯魯在臨死前送給它的Ｘ抗體而Ｘ化。戰斗暴龍獸：保護了迪哥獸免遭奧米加獸的致命攻擊，與奧米加獸作戰之后又投入到對抗大批多路龍獸的戰斗之中。鋼鐵加魯魯：為保護多路獸和迪哥獸而死，后復活再度出現，參與對抗大批多路龍獸的戰斗。伽樓達獸：奧米加獸出現時試圖逃跑但仍喪命在其炮下。而它向奧米加獸的最后一擊被奧米加獸輕易化解了。小古加獸：奧米加獸出現時試圖逃跑不及，喪命在其炮下。猿人獸、花妖獸、安杜路獸：不同意戰斗暴龍獸的“世界毀滅觀”，向世界樹請示后生存在新世界，但最終仍喪命在奧米加獸的劍下。奧米加獸：皇家騎士之一。始終忠于世界樹的「Ｘ計劃」并積極執行。無數數碼獸喪命于它手中。后為調查「Ｘ計劃」真相，與阿爾法獸一同去面見世界樹。公爵獸：皇家騎士之一。對世界樹執行「Ｘ計劃」一直抱有疑問，后決定背離皇家騎士團，輸給奧米加獸而前往數據空間探查，返回后獲得Ｘ抗體，投入到對抗大批多路龍獸的戰斗中去。為多路龍獸打通了通往世界樹的大門。瑪格納獸：皇家騎士之一。相信世界樹的「Ｘ計劃」。不同意多路龍獸/阿爾法獸與奧米加獸為調查「Ｘ計劃」真相而面見世界樹。木乃伊獸：一開始并不理解巫師獸對多路加獸的幫助，對保護多路加獸不是很贊同。后歪打正著，一槍堵死路口，阻止了多路龍獸隊伍的攻入。巫師獸：好心的巫師獸抬著受創的多路加獸，一直到了一個安全的地方。后決定保護多路加獸。順便說一句，它的聲優可是日本聲優之王——石田彰哦。人面戰鷹獸：同意保護多路加獸，后在大批多路龍獸襲擊之時奮然抵抗。多路龍獸(與主角多路獸所進化的多路龍獸可不一樣哦)：大批多路龍獸被世界樹制造出來去攻擊多路獸及它的伙伴們。蘑菇獸：一開始的蘑菇獸三兄弟對多路獸采取排斥態度，而后來在大批多路龍獸襲擊之時的大批蘑菇獸成為被疏散的對象，后蘑菇獸群雖反擊，但力量薄弱。角龍獸、三角龍獸、巨龍獸：在大批多路龍獸襲擊之時成為被疏散的對象。劍皇獸：始終沒有在本片中正式露面，僅僅是其聲優在第14分鐘時有一句臺詞「異な事を…」而已。