青井和哉（市來光弘配音）是一個善良平凡的少年，姐姐青井和葉（能登麻美子配音）的死卻永遠的改變了他將來的道路。襲擊和葉的，是一種名叫“NOVA”的異次元體，為了替姐姐報仇，和哉進入了培養與異次元體戰斗的戰士的專門學校——杰尼提克斯學院。在學院中，學員們被分為潘多拉與制御者兩種類別，就這樣，和哉結識了一群外表柔弱實力卻異常強大的女孩子們。其中，被稱為最強潘多拉的莎緹萊薩（能登麻美子配音）最讓和哉感到在意，在機緣巧合之下，和哉竟然和她結成了搭檔。此外，還有外剛內柔的傲嬌娘嘉涅沙（喜多村英梨配音），神秘的西藏轉學生拉娜林沁（花澤香菜配音）等人。在戰斗和學習的過程中，和哉下定決心，一定要揭開姐姐死亡的謎團。