《記憶女神的女兒們》這部動畫設定是以東京和新宿為舞臺，穿插著著艱巨的打斗與懸念，瘋狂的愛情的奇特SF動作片。在西新宿做著資詢業業務的磷有一個秘密……她對于在新宿發生的脫離常軌的連續殺人事件、要人被害以及使用生物武器的恐怖主義事件感到了懷疑。那么這些事件之間到底會有些什么的關聯呢？磷和助手咪咪開始向這些疑問挑戰。可是，不久磷就受到了不明來歷暗殺者——獵人蘿拉的狙擊。一位外表看起來宛如少年，其實有著倒錯的美學意識、年齡不詳的人物A BOSS，和青山制藥狹山研究所所長、性虐狂的科學家沙耶羅等人，都出現在了磷的面前。
話說在具體的設定里有沒有如《圣斗士》一樣和神話的對號入座我們現在還不得而知，但是萬一沒有對應而只是打著“繆斯女神”的幌子的話，那么恐怕本作的一大主題就是泛之四海皆相宜的——“愛和命咧�神帶來的無奈”了吧……