所有的一切都是圍繞著一個由政府負責研發的最新的秘密計劃展開的，他們正在有組織地訓練動物去完成人類不可能涉足到的間諜偵察任務，于是就出現了那么幾只全身都被最先進的高科技設備重重地武裝起來的小豚鼠，在經歷了層層關卡的測試和篩選之后，終于順利通過考試，正式成為特工。可是讓他們始料不及的是，在這個過程中，整個世界最終的命撸�竟然都掌握在了他們小小的爪子里。

　　“豚鼠特工隊”的成員分別包括：達爾文(山姆·洛克威爾配音)，身為隊長的他，擁有著冷靜的頭腦和敏銳的判斷力，更有著堅韌的毅力，是那種不惜任何代表都要取得決勝性的成功的天生領袖；布拉斯特(崔西·摩根配音)則是一個冷酷無情的武器專家，總是喜歡表達過多的姿態和看法，對于任何極端的事物都有著極大的興趣；隊里惟一的雌性成員華雷絲(佩內洛普·克魯茲配音)性感美麗，卻是一個非常擅長近身搏斗的職業武術家；最后是被稱為“永遠不可能被察覺”的偵察員斯派克爾斯(尼古拉斯·凱奇配音)，他是一只星鼻鼴，同時也是小分隊里的電腦專家和信息技術人員。

　　一路走來，“豚鼠特工隊”在執行任務的時候，結識了無數個來自于另外一個動物王國的成員，包括生長在寵物店的“懶家伙”赫爾利(喬恩·費儒配音)，還有一只擁有著強烈的領地意識的倉鼠巴基(史蒂夫·布西密配音)，他們將一起展開一場驚險到讓人眼花繚亂且非常瘋狂的危險之旅，而他們所做到的一切，再一次用事實證明了-不管身高尺寸有多大，都可以成為這個世界迫切需要的真正的英雄。